iOS4.0.1以降でリリースされたXcodeをインストール後、過去のSDK3.2で作成したプロジェクトで「Base SDK Missing」と表示されるようになります。
プロジェクト＞プロジェクト設定の編集からベースSDKを設定します。
これで、プロジェクトのビルドはできるようになると思います。
ただ、実機で検証している場合、まだ「Base SDK Missing」と表示される事があると思います。
その場合、「option+mouse click」で実行オプションをクリックし、iOSを選択すれば、解決すると思います。
